西暦2050年。最新鋭ステルス戦闘機「蒼莱」のパイロット・如月蓮は、任務中に未知の電磁パルスと空間歪曲に巻き込まれ、1941年へと飛ばされてしまう。
目を覚ました蓮の前に広がっていたのは、真珠湾攻撃を目前に控えた日本海軍・南雲機動部隊。
そこは、彼が生きていた時代から遥か昔の世界だった。
しかし蓮には、未来の知識がある。
そして、彼だけに寄り添う人工知能「A.I.D.A.」がいる。
「歴史を変えてはいけない」
そう考えていたはずの蓮だったが、目の前で起こる出来事は、彼に選択を迫っていく。
未来の技術を持つ一人のパイロットが、1941年の日本に現れたとき――。
太平洋戦争の歴史は、静かに動き始める。