西暦20XX年
人類は隕石と共に飛来した外宇宙からの侵略者を相手に、徐々に生存圏を奪われていた。
侵略者『由来の技術によって作り出されたパワードスーツ『アイギスフレーム』とソレを操る、少年少女『スパルトイ』の戦線投入により、かろうじて戦争が成り立っている中、人類は確実に追い詰められていた。
希望の光が小さくなり行くその最中、人類にとっても、侵略者にとっても予期せぬイレギュラーが発生する。
眠れる『女吸血鬼』の目覚め。
伝説と歴史の中に埋没した存在が、侵略者に蹂躙された地上と人類と出会う時、戦争の天秤は、大きく揺れ始めるのだった。