空駆ける船、飛空艦の発明から半世紀。禍艦(まがぶね)と呼ばれる高性能飛空艦を有するアウストムネシア帝国が戦端を切り、彗州(すいしゅう)全土を巻き込んだ魔女戦争の終結から三年。
彗州の西端の島国、エゼルベシア王国でユフ＝ハウェイズは新型飛空艦の擱座事件に端を発する舌戦でエゼルベシア空中艦隊を免官される。
子供の頃から飛空艦の指揮艦に憧れたユフを見初めた隣国である妖精族の国ベルティナの王女フィチは、ユフに自分の伴侶として巡空戦艦『スカアハ』に乗艦してくれと願う。
そして『スカアハ』と共にベルティナに渡ったユフとフィチだが、時同じくして彗州ではとある陰謀が進行していたのだった……。